Як і більшість дипломатичних місій іноземних держав в Москві, посольство Португалії розміщується в Центральному адміністративному окрузі. Воно займає двоповерхову будівлю під номером 1 в Ботанічному провулку Міщанського району.

Своїй назві провулок зобов'язаний близькості до ботанічного саду Московського університету, зараз відомому як «Аптекарський город».

Будинок стоїть на розі двох провулків, тому іноді замість офіційної адреси (пер. Ботанічний, 1), в деяких джерелах вказується інший, пров. Грохольський, 3. Це не зовсім точно, хоча знайти посольство можна і за цією інформацією.

Найближчими до нього станціями метро є «Проспект Миру», «Сухаревська».